تمتلك كبريتات الستربتوميسين تأثيرات مضادة للجراثيم على معظم البكتيريا إيجابية الجرام وسالبة الجرام، وخاصة على البكتيريا سالبة الجرام المختلفة مثل الإشريكية القولونية، السالمونيلا، الباستوريلا، البروسيلا، الالتهاب الرئوي، الشيجلا، الزائفة الزنجارية، والزائفة الزنجارية. هذا المنتج هو الدواء المفضل لبكتيريا السل، مع تأثيرات قوية مضادة للجراثيم عند التركيزات المنخفضة وتأثيرات قاتلة للجراثيم عند التركيزات العالية. ونظرًا لقدرته على اختراق الخلايا الجسدية بنسبة 10% فقط، فهو غير فعال ضد بكتيريا السل داخل الخلايا ويمكنه فقط قتل بكتيريا السل خارج الخلية. له تأثير مبيد للجراثيم أقوى على البكتيريا خلال فترة الإنجاب منه على البكتيريا خلال فترة الراحة. على عكس البنسلين، فإن معدل قتله للجراثيم يتناسب طرديا مع تركيز الدواء. يكون تأثيره المضاد للبكتيريا أقوى عند الرقم الهيدروجيني 7.8، ويضعف بشكل كبير عندما ينخفض الرقم الهيدروجيني إلى أقل من 6.
تنتمي سلفات الستربتوميسين الزراعية إلى فئة المبيدات الفطرية المضادات الحيوية ولها تأثير وقائي على الأمراض البكتيرية للمحاصيل المختلفة وكذلك بعض الأمراض الفطرية.